Das Evangelische Bildungswerk ist ein eingetragener Verein. Es ist beim Amtsgericht Nürnberg unter der Nummer 10207 in das Vereinsregister eingetragen. Der Verein wird geleitet durch einen sechsköpfigen Vorstand, der von der Mitgliederversammlung gewählt wird.
Der Programmausschuss des EBW berät über die "Gemeinsamen Veranstaltungen" und sammelt Vorschläge für die Programmgestaltung.
Das Evangelische Bildungswerk ist Mitglied der Arbeitsgemeinschaft für Evangelische Erwachsenenbildung in Bayern (AEEB) e. V. mit Sitz in München.
Es betreibt Qualitätsentwicklung nach dem Modell "Qualitätsentwicklung im Verbund von Bildungseinrichtungen" (QVB) und arbeitet in einem regionalen Qualitätszirkel mit anderen Bildungswerken zusammen.